Hiệp Hội Doanh Nghiệp Nhật Bản tại Việt Nam được thành lập với mục đích nhằm giao lưu, nâng cao tính thân thiết giữa các hội viên và tạo mối quan hệ hữu hảo, giao lưu văn hóa giữa 2 nước Nhật – Việt đồng thời thúc đẩy hợp tác thương mại và kinh tế giữa 2 nước.

Hiệp hội doanh nghiệp Nhật Bản hoạt động không vì mục đích lợi nhuận. Ngoài ra, Hiệp hội không triển khai dự án vì mục đích lợi nhuận cho một cá nhân hoặc pháp nhân và đoàn thể. Hiệp hội không tham gia hoạt động chính trị.